针对甲型H1N1流感患者，国务院相关部门高度重视医疗救治工作，并采取措施解决医疗费用问题。根据卫生部、财政部、人力资源社会保障部、民政部去年8月起陆续出台的文件，甲流患者及发热或急性呼吸道症状可到各地甲流定点医疗机构进行医学排查和治疗，费用可按规定报销。对于未参加城镇职工基本医疗保险制度、城镇居民医疗保险制度或新型农村合作医疗制度的患者，或经上述制度报销后个人医疗救治费用负担仍较重的贫困患者，可通过城乡医疗救助制度解决。

据《羊城晚报》报道，国务院已有了加强甲流重症患者治疗的具体措施，但未得到落实。钟南山院士表示，国家在甲流防控前阶段的工作表现出色，但重症患者治疗方面的问题，主要出现在社保部门与卫生部门之间。钟南山透露，相关救助机制本应由卫生部调控经费，但由于卫生部没有额外的经费，将交给了社保部门。

钟南山表示，当前问题并非出在卫生部门不重视重症患者治疗，而是社保部门与卫生部门在资金分配上存在问题。他希望国家能出台针对重症患者的特殊救助政策，以避免因资金问题而导致患者被遗弃的悲剧再次发生。